九寨沟和里泽沟分布着数百个贝壳，主要是生物岩溶作用引起的岩溶作用形成的喀斯特湖。它们是一种特殊的岩溶地质现象和岩溶地貌。九寨沟喀斯特灰岩堤坝是一种沉积作用，仅在特定的环境地球化学条件下才会发生。
在九寨沟周围一千多平方公里的区域内，裸露的地层都是从泥盆纪到三叠纪碳酸盐岩，其中泥盆纪、石炭纪和下三叠纪碳酸盐岩的重点是纯石灰岩占主导地位，少量石灰石、白云石或不溶性岩石的数量，为岩溶现象提供物质基础。
九寨沟地区植被茂密是形成喀斯特灰岩最重要的因素。这里的生物岩溶作用体现在两个方面：一是增加土壤中二氧化碳的含量，二是通过生物光合作用引起碳酸钙的沉积。对于九寨沟来说，后者尤为重要。当生物体进行光合作用时，它吸收二氧化碳并导致水中的碳酸钙饱和或接近饱和并沉积。这样的灰状沉积物通常包含许多生物，并且堆积速度也非常快。
从南斯拉夫十六湖的地理位置和九寨沟的相似地理位置，可以得出这样的大型灰坝只能在植被茂密，温度不高的喀斯特地区发生。
九寨沟位于青藏高原东侧至四川盆地陡坡的过渡带。温度低。在这种气候条件下，化学侵蚀减弱，而冻结和机械侵蚀的物理作用非常强，岩石的倾角相对较高。大的，形状像石芽、的石林和其他地貌，只有陡峭的岩壁和石灰石碎屑沉积物。
在地质上，不仅有较厚的透水石灰岩层，而且岩石层被强烈挤压、褶皱、断裂、的节理和发育，这更有利于地表水的渗透，而岩石的倾角较大，使沿水位低的地下水易于看见，形成地下地下水流。
海拔较高，周围的山峰与山谷底部的高度差较高。前者使温度低，表面化学侵蚀得到抑制；后者使高山的雨雪渗入山脚，而底部水具有足够的高度差，然后才重新流出地面。它确保了地热能的增加可以达到重新激活地下化学侵蚀的温度。
大量的雨水加上周围高大的白雪皑皑的山脉，可以成为稳定供水的坚实水库，确保为地面沉积提供必要的供水，以防止地下侵蚀。
植被覆盖良好，枯死的树枝和树叶的分解会提供大量的二氧化碳，从而增加了水中的碳酸含量。同时，水源保持水土流失，大大减少了地质灾害的威胁。